Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd11P23813 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxd11P23813 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms