Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata3P23772 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata3P23772 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata3P23772 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata3P23772 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gata3P23772 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata3P23772 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata3P23772 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata3P23772 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata3P23772 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata3P23772 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata3P23772 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata3P23772 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata3P23772 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms