Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkchP23298 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkchP23298 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkchP23298 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkchP23298 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkchP23298 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkchP23298 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkchP23298 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkchP23298 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkchP23298 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkchP23298 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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