Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja1P23242 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja1P23242 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gja1P23242 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja1P23242 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gja1P23242 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja1P23242 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja1P23242 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja1P23242 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja1P23242 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja1P23242 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gja1P23242 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja1P23242 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja1P23242 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja1P23242 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja1P23242 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja1P23242 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja1P23242 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja1P23242 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja1P23242 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja1P23242 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja1P23242 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja1P23242 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja1P23242 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja1P23242 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja1P23242 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja1P23242 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja1P23242 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja1P23242 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja1P23242 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja1P23242 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja1P23242 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja1P23242 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja1P23242 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja1P23242 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja1P23242 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja1P23242 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja1P23242 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja1P23242 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gja1P23242 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja1P23242 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja1P23242 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja1P23242 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja1P23242 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja1P23242 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja1P23242 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja1P23242 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja1P23242 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja1P23242 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja1P23242 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gja1P23242 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja1P23242 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja1P23242 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja1P23242 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms