Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RarbP22605 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RarbP22605 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RarbP22605 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RarbP22605 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RarbP22605 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RarbP22605 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RarbP22605 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RarbP22605 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RarbP22605 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RarbP22605 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RarbP22605 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RarbP22605 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RarbP22605 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RarbP22605 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RarbP22605 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RarbP22605 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RarbP22605 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RarbP22605 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RarbP22605 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RarbP22605 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RarbP22605 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RarbP22605 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RarbP22605 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RarbP22605 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RarbP22605 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RarbP22605 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RarbP22605 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RarbP22605 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RarbP22605 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RarbP22605 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RarbP22605 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RarbP22605 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RarbP22605 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RarbP22605 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RarbP22605 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RarbP22605 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RarbP22605 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RarbP22605 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RarbP22605 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RarbP22605 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RarbP22605 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RarbP22605 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RarbP22605 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RarbP22605 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RarbP22605 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RarbP22605 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RarbP22605 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RarbP22605 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RarbP22605 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RarbP22605 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RarbP22605 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RarbP22605 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RarbP22605 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RarbP22605 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RarbP22605 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RarbP22605 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RarbP22605 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RarbP22605 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RarbP22605 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RarbP22605 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RarbP22605 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RarbP22605 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RarbP22605 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RarbP22605 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RarbP22605 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RarbP22605 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RarbP22605 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RarbP22605 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RarbP22605 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RarbP22605 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RarbP22605 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RarbP22605 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RarbP22605 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RarbP22605 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RarbP22605 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RarbP22605 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RarbP22605 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RarbP22605 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RarbP22605 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RarbP22605 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RarbP22605 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RarbP22605 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RarbP22605 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RarbP22605 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RarbP22605 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RarbP22605 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RarbP22605 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RarbP22605 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RarbP22605 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RarbP22605 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RarbP22605 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RarbP22605 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RarbP22605 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RarbP22605 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RarbP22605 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RarbP22605 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RarbP22605 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RarbP22605 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RarbP22605 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms