Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tap1P21958 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tap1P21958 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tap1P21958 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tap1P21958 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tap1P21958 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tap1P21958 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tap1P21958 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tap1P21958 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tap1P21958 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tap1P21958 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tap1P21958 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tap1P21958 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tap1P21958 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tap1P21958 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tap1P21958 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tap1P21958 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tap1P21958 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tap1P21958 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tap1P21958 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tap1P21958 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tap1P21958 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tap1P21958 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms