Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VimP20152 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VimP20152 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VimP20152 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VimP20152 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VimP20152 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VimP20152 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VimP20152 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VimP20152 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VimP20152 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VimP20152 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VimP20152 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VimP20152 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VimP20152 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VimP20152 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VimP20152 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VimP20152 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VimP20152 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VimP20152 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VimP20152 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VimP20152 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VimP20152 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VimP20152 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VimP20152 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VimP20152 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VimP20152 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VimP20152 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VimP20152 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VimP20152 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VimP20152 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VimP20152 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VimP20152 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VimP20152 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VimP20152 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VimP20152 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VimP20152 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VimP20152 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VimP20152 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VimP20152 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VimP20152 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VimP20152 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VimP20152 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VimP20152 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VimP20152 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VimP20152 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VimP20152 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VimP20152 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VimP20152 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VimP20152 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VimP20152 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VimP20152 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VimP20152 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VimP20152 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VimP20152 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VimP20152 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VimP20152 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VimP20152 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VimP20152 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VimP20152 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VimP20152 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VimP20152 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VimP20152 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VimP20152 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VimP20152 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VimP20152 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VimP20152 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VimP20152 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VimP20152 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VimP20152 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VimP20152 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VimP20152 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VimP20152 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VimP20152 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VimP20152 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VimP20152 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VimP20152 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VimP20152 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VimP20152 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VimP20152 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VimP20152 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VimP20152 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VimP20152 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VimP20152 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VimP20152 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VimP20152 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VimP20152 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VimP20152 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VimP20152 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VimP20152 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VimP20152 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VimP20152 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VimP20152 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VimP20152 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VimP20152 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VimP20152 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VimP20152 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VimP20152 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VimP20152 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VimP20152 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VimP20152 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms