Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lsp1P19973 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsp1P19973 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms