Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnc1P19123 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnnc1P19123 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms