Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Q9P14431 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms