Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb2P13373 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms