Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nr4a1P12813 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nr4a1P12813 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms