Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P10404 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P10404 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P10404 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P10404 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
P10404 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P10404 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P10404 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P10404 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P10404 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P10404 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
P10404 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
P10404 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
P10404 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P10404 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P10404 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P10404 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P10404 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P10404 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P10404 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P10404 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P10404 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P10404 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P10404 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P10404 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P10404 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P10404 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P10404 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P10404 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P10404 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P10404 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P10404 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P10404 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P10404 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P10404 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P10404 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P10404 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P10404 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P10404 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P10404 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P10404 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P10404 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
P10404 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P10404 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P10404 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P10404 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P10404 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P10404 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P10404 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P10404 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P10404 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P10404 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P10404 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P10404 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P10404 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P10404 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
P10404 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P10404 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P10404 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P10404 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
P10404 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
P10404 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P10404 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P10404 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
P10404 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
P10404 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P10404 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
P10404 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
P10404 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P10404 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
P10404 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P10404 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P10404 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P10404 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P10404 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
P10404 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P10404 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
P10404 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P10404 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
P10404 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P10404 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P10404 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P10404 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P10404 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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