Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd8bP10300 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd8bP10300 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd8bP10300 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms