Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxc9P09633 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxc9P09633 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxc9P09633 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxc9P09633 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxc9P09633 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxc9P09633 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Hoxc9P09633 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxc9P09633 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms