Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna9P09235 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifna9P09235 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms