Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax1P09084 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax1P09084 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax1P09084 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pax1P09084 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax1P09084 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax1P09084 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax1P09084 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax1P09084 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax1P09084 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax1P09084 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax1P09084 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pax1P09084 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax1P09084 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax1P09084 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms