Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa5P09021 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms