Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NefmP08553 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NefmP08553 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NefmP08553 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NefmP08553 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NefmP08553 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NefmP08553 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NefmP08553 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NefmP08553 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NefmP08553 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NefmP08553 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NefmP08553 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NefmP08553 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NefmP08553 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NefmP08553 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NefmP08553 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NefmP08553 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NefmP08553 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NefmP08553 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NefmP08553 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NefmP08553 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NefmP08553 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NefmP08553 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NefmP08553 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NefmP08553 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NefmP08553 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NefmP08553 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NefmP08553 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NefmP08553 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NefmP08553 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NefmP08553 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NefmP08553 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NefmP08553 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NefmP08553 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NefmP08553 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NefmP08553 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NefmP08553 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
NefmP08553 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NefmP08553 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NefmP08553 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NefmP08553 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NefmP08553 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NefmP08553 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NefmP08553 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NefmP08553 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NefmP08553 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NefmP08553 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NefmP08553 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NefmP08553 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NefmP08553 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NefmP08553 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NefmP08553 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NefmP08553 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NefmP08553 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NefmP08553 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NefmP08553 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NefmP08553 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NefmP08553 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NefmP08553 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NefmP08553 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NefmP08553 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NefmP08553 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NefmP08553 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NefmP08553 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NefmP08553 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NefmP08553 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NefmP08553 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NefmP08553 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NefmP08553 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NefmP08553 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NefmP08553 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NefmP08553 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NefmP08553 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NefmP08553 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NefmP08553 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NefmP08553 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NefmP08553 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NefmP08553 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NefmP08553 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NefmP08553 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NefmP08553 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NefmP08553 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NefmP08553 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NefmP08553 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NefmP08553 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NefmP08553 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NefmP08553 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NefmP08553 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NefmP08553 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NefmP08553 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NefmP08553 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NefmP08553 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NefmP08553 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NefmP08553 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NefmP08553 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NefmP08553 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NefmP08553 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NefmP08553 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
NefmP08553 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NefmP08553 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms