Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna4P07351 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna4P07351 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms