Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TtrP07309 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtrP07309 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtrP07309 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TtrP07309 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TtrP07309 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtrP07309 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtrP07309 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtrP07309 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtrP07309 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtrP07309 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtrP07309 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtrP07309 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtrP07309 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtrP07309 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtrP07309 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtrP07309 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtrP07309 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtrP07309 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtrP07309 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TtrP07309 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtrP07309 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtrP07309 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtrP07309 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtrP07309 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtrP07309 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtrP07309 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtrP07309 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtrP07309 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtrP07309 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtrP07309 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtrP07309 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtrP07309 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtrP07309 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtrP07309 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtrP07309 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtrP07309 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtrP07309 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtrP07309 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtrP07309 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtrP07309 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TtrP07309 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtrP07309 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtrP07309 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtrP07309 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtrP07309 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtrP07309 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtrP07309 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtrP07309 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TtrP07309 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TtrP07309 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtrP07309 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtrP07309 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtrP07309 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtrP07309 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtrP07309 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtrP07309 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtrP07309 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TtrP07309 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TtrP07309 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TtrP07309 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TtrP07309 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TtrP07309 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TtrP07309 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TtrP07309 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TtrP07309 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TtrP07309 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtrP07309 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtrP07309 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TtrP07309 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtrP07309 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtrP07309 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtrP07309 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtrP07309 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TtrP07309 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TtrP07309 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TtrP07309 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtrP07309 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtrP07309 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtrP07309 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtrP07309 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtrP07309 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtrP07309 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtrP07309 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms