Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06323 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06323 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06323 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06323 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P06323 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P06323 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P06323 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P06323 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P06323 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P06323 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P06323 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P06323 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P06323 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P06323 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P06323 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P06323 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P06323 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P06323 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P06323 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P06323 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P06323 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P06323 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P06323 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P06323 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06323 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06323 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06323 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06323 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06323 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06323 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06323 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06323 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06323 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06323 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06323 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06323 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06323 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06323 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06323 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06323 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06323 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06323 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06323 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06323 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06323 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06323 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06323 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06323 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06323 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06323 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06323 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06323 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06323 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06323 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P06323 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06323 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06323 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06323 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06323 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06323 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06323 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06323 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06323 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06323 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06323 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06323 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06323 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06323 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06323 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06323 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06323 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06323 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06323 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06323 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P06323 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06323 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06323 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06323 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06323 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06323 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06323 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06323 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06323 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06323 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P06323 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06323 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06323 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06323 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06323 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06323 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06323 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06323 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06323 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06323 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06323 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06323 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06323 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06323 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06323 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms