Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgamP05555 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgamP05555 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgamP05555 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgamP05555 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgamP05555 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgamP05555 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgamP05555 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgamP05555 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgamP05555 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgamP05555 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgamP05555 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgamP05555 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgamP05555 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgamP05555 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms