Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GzmbP04187 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GzmbP04187 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GzmbP04187 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GzmbP04187 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GzmbP04187 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GzmbP04187 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GzmbP04187 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GzmbP04187 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GzmbP04187 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GzmbP04187 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GzmbP04187 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GzmbP04187 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GzmbP04187 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GzmbP04187 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GzmbP04187 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GzmbP04187 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GzmbP04187 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GzmbP04187 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GzmbP04187 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms