Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tp53P02340 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tp53P02340 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tp53P02340 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tp53P02340 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tp53P02340 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tp53P02340 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tp53P02340 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tp53P02340 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tp53P02340 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tp53P02340 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.2 ms