Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01789 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01789 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01789 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01789 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01789 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01789 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01789 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01789 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01789 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01789 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01789 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01789 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01789 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01789 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01789 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01789 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01789 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01789 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01789 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01789 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01789 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01789 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01789 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01789 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01789 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01789 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01789 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01789 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01789 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01789 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01789 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01789 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01789 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01789 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01789 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01789 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01789 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01789 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01789 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01789 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01789 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01789 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01789 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01789 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01789 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01789 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01789 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01789 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01789 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01789 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01789 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01789 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01789 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01789 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01789 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01789 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01789 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01789 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01789 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01789 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01789 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01789 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01789 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01789 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01789 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01789 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01789 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01789 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01789 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01789 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01789 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01789 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01789 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01789 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01789 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01789 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01789 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01789 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01789 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01789 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01789 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01789 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01789 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01789 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01789 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01789 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01789 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01789 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01789 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01789 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01789 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01789 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01789 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01789 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01789 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01789 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01789 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01789 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01789 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms