Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01788 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01788 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01788 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01788 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01788 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01788 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01788 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01788 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01788 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01788 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01788 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01788 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01788 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01788 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01788 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01788 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01788 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01788 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01788 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01788 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01788 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01788 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01788 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01788 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01788 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01788 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01788 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01788 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01788 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01788 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01788 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01788 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01788 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01788 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01788 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01788 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01788 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01788 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01788 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01788 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01788 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01788 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01788 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01788 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01788 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01788 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01788 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01788 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01788 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01788 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01788 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01788 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01788 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01788 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01788 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01788 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01788 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01788 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01788 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01788 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01788 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01788 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01788 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01788 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01788 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01788 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01788 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01788 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01788 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01788 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01788 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01788 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01788 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01788 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01788 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01788 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01788 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01788 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01788 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01788 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01788 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01788 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01788 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01788 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01788 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01788 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01788 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01788 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01788 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01788 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01788 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01788 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01788 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01788 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01788 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01788 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01788 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01788 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01788 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms