Protein–RNA interactions for Protein: P01786

Ig heavy chain V region MOPC 47A, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01786 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01786 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01786 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01786 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01786 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01786 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01786 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01786 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01786 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01786 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01786 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01786 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01786 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01786 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01786 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01786 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01786 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01786 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01786 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01786 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01786 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01786 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01786 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01786 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01786 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01786 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01786 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01786 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01786 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01786 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01786 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01786 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01786 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01786 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01786 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01786 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01786 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01786 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01786 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01786 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01786 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01786 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01786 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01786 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01786 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01786 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01786 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01786 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01786 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01786 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01786 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01786 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01786 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01786 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01786 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01786 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01786 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01786 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01786 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01786 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01786 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01786 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01786 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01786 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01786 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01786 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01786 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01786 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01786 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01786 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01786 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01786 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01786 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01786 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01786 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01786 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01786 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01786 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01786 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01786 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01786 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01786 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01786 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01786 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 368.5 ms