Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01757 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01757 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01757 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01757 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01757 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01757 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01757 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01757 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01757 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01757 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01757 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01757 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01757 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01757 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01757 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01757 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01757 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01757 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01757 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01757 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01757 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01757 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01757 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01757 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01757 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01757 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01757 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01757 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01757 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01757 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01757 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01757 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01757 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01757 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01757 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01757 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01757 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01757 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01757 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01757 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01757 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01757 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01757 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01757 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01757 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01757 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01757 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01757 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01757 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01757 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01757 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01757 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01757 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01757 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01757 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01757 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01757 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01757 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01757 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01757 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01757 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01757 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01757 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01757 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01757 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01757 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01757 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01757 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01757 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01757 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01757 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01757 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01757 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01757 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01757 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01757 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01757 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01757 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01757 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01757 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01757 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01757 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms