Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01741 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01741 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01741 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01741 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01741 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01741 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01741 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01741 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01741 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01741 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01741 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01741 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01741 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01741 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01741 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01741 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01741 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01741 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01741 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01741 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01741 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01741 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01741 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01741 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01741 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01741 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01741 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01741 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01741 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01741 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01741 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01741 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01741 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01741 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01741 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01741 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01741 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01741 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01741 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01741 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01741 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01741 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01741 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01741 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01741 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01741 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01741 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01741 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01741 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01741 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01741 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01741 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01741 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01741 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01741 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01741 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01741 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01741 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01741 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01741 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01741 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01741 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01741 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01741 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01741 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01741 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01741 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01741 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01741 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01741 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01741 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01741 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01741 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01741 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01741 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01741 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01741 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01741 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01741 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01741 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01741 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01741 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01741 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01741 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01741 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01741 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01741 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01741 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01741 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01741 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01741 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01741 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01741 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01741 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01741 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01741 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01741 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01741 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01741 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms