Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01734 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01734 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01734 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01734 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01734 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01734 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01734 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01734 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01734 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01734 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01734 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01734 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01734 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01734 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01734 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01734 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01734 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01734 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01734 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01734 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01734 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01734 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01734 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01734 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01734 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01734 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01734 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01734 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01734 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01734 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01734 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01734 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01734 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01734 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01734 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01734 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01734 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
P01734 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01734 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01734 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01734 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
P01734 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01734 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01734 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01734 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01734 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01734 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
P01734 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01734 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01734 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01734 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
P01734 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
P01734 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01734 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01734 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01734 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01734 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01734 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01734 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01734 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01734 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01734 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01734 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01734 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
P01734 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01734 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01734 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01734 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01734 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01734 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01734 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01734 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01734 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01734 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01734 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01734 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01734 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01734 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01734 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01734 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01734 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01734 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01734 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01734 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01734 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01734 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01734 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01734 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01734 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01734 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01734 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01734 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01734 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01734 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01734 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01734 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01734 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01734 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01734 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms