Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01727 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01727 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01727 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01727 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01727 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01727 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01727 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01727 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01727 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01727 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P01727 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01727 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01727 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01727 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01727 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01727 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01727 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01727 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01727 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01727 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01727 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01727 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01727 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01727 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01727 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01727 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01727 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01727 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01727 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01727 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01727 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01727 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01727 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01727 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01727 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01727 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01727 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01727 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01727 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01727 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01727 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01727 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01727 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01727 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01727 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01727 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01727 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01727 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01727 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01727 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01727 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01727 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01727 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01727 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01727 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01727 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01727 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01727 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01727 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01727 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01727 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01727 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01727 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01727 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01727 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01727 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01727 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01727 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01727 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01727 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01727 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01727 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01727 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01727 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01727 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01727 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01727 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01727 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01727 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01727 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01727 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01727 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01727 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms