Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
P01648 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01648 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01648 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
P01648 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01648 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01648 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01648 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01648 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01648 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01648 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01648 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01648 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01648 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01648 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01648 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01648 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01648 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
P01648 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01648 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01648 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01648 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01648 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01648 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01648 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01648 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01648 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01648 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01648 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01648 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01648 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01648 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
P01648 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01648 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01648 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01648 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01648 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01648 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01648 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01648 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01648 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
P01648 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01648 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01648 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01648 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01648 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01648 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01648 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01648 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01648 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01648 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01648 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01648 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01648 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01648 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01648 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01648 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01648 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01648 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01648 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01648 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
P01648 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01648 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01648 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
P01648 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01648 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01648 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01648 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01648 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01648 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01648 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01648 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01648 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01648 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01648 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
P01648 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01648 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01648 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01648 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01648 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01648 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01648 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01648 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01648 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01648 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01648 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01648 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01648 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01648 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01648 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01648 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01648 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01648 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01648 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01648 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01648 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01648 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01648 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01648 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01648 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms