Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifnb1P01575 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifnb1P01575 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifnb1P01575 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms