Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl1O89112 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl1O89112 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lancl1O89112 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lancl1O89112 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lancl1O89112 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lancl1O89112 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lancl1O89112 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lancl1O89112 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lancl1O89112 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lancl1O89112 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lancl1O89112 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lancl1O89112 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms