Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp8O89110 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp8O89110 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp8O89110 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp8O89110 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp8O89110 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casp8O89110 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp8O89110 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp8O89110 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp8O89110 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp8O89110 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp8O89110 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casp8O89110 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp8O89110 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp8O89110 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp8O89110 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp8O89110 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp8O89110 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Casp8O89110 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms