Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl20O89093 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccl20O89093 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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