Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp1O89090 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp1O89090 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sp1O89090 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp1O89090 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp1O89090 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp1O89090 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sp1O89090 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sp1O89090 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp1O89090 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp1O89090 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp1O89090 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp1O89090 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sp1O89090 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp1O89090 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp1O89090 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp1O89090 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sp1O89090 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp1O89090 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sp1O89090 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp1O89090 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp1O89090 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sp1O89090 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sp1O89090 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp1O89090 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp1O89090 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sp1O89090 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sp1O89090 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp1O89090 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp1O89090 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp1O89090 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp1O89090 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp1O89090 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sp1O89090 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp1O89090 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp1O89090 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp1O89090 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms