Protein–RNA interactions for Protein: O89033

Cdc6, Cell division control protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc6O89033 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc6O89033 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc6O89033 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc6O89033 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms