Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Robo1O89026 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Robo1O89026 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Robo1O89026 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Robo1O89026 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Robo1O89026 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Robo1O89026 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Robo1O89026 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Robo1O89026 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Robo1O89026 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms