Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a3O88561 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc27a3O88561 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc27a3O88561 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc27a3O88561 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc27a3O88561 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc27a3O88561 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc27a3O88561 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc27a3O88561 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc27a3O88561 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc27a3O88561 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc27a3O88561 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc27a3O88561 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc27a3O88561 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc27a3O88561 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc27a3O88561 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms