Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CntfrO88507 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CntfrO88507 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CntfrO88507 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CntfrO88507 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CntfrO88507 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CntfrO88507 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CntfrO88507 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfrO88507 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfrO88507 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfrO88507 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfrO88507 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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