Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme6O88425 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme6O88425 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme6O88425 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme6O88425 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme6O88425 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme6O88425 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme6O88425 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme6O88425 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme6O88425 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms