Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AvilO88398 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AvilO88398 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AvilO88398 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AvilO88398 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AvilO88398 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AvilO88398 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AvilO88398 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AvilO88398 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AvilO88398 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AvilO88398 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AvilO88398 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AvilO88398 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AvilO88398 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AvilO88398 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AvilO88398 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AvilO88398 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AvilO88398 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AvilO88398 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AvilO88398 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AvilO88398 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AvilO88398 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AvilO88398 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AvilO88398 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AvilO88398 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AvilO88398 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AvilO88398 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AvilO88398 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AvilO88398 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AvilO88398 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AvilO88398 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AvilO88398 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AvilO88398 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AvilO88398 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AvilO88398 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AvilO88398 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AvilO88398 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AvilO88398 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AvilO88398 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AvilO88398 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AvilO88398 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AvilO88398 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AvilO88398 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AvilO88398 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AvilO88398 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AvilO88398 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AvilO88398 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AvilO88398 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AvilO88398 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AvilO88398 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AvilO88398 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AvilO88398 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AvilO88398 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AvilO88398 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AvilO88398 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AvilO88398 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AvilO88398 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AvilO88398 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AvilO88398 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AvilO88398 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AvilO88398 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AvilO88398 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AvilO88398 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AvilO88398 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AvilO88398 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AvilO88398 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AvilO88398 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AvilO88398 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AvilO88398 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AvilO88398 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AvilO88398 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AvilO88398 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AvilO88398 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AvilO88398 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AvilO88398 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AvilO88398 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AvilO88398 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AvilO88398 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AvilO88398 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AvilO88398 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AvilO88398 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AvilO88398 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AvilO88398 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AvilO88398 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AvilO88398 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AvilO88398 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AvilO88398 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AvilO88398 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AvilO88398 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AvilO88398 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AvilO88398 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AvilO88398 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AvilO88398 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AvilO88398 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AvilO88398 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AvilO88398 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AvilO88398 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AvilO88398 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AvilO88398 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AvilO88398 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms