Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nid2O88322 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nid2O88322 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nid2O88322 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nid2O88322 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nid2O88322 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nid2O88322 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nid2O88322 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nid2O88322 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nid2O88322 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nid2O88322 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nid2O88322 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nid2O88322 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms