Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CtssO70370 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtssO70370 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtssO70370 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtssO70370 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtssO70370 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtssO70370 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtssO70370 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtssO70370 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtssO70370 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtssO70370 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CtssO70370 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtssO70370 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtssO70370 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CtssO70370 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtssO70370 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtssO70370 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CtssO70370 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CtssO70370 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CtssO70370 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtssO70370 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtssO70370 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtssO70370 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtssO70370 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtssO70370 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtssO70370 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtssO70370 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtssO70370 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtssO70370 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CtssO70370 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtssO70370 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtssO70370 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtssO70370 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CtssO70370 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtssO70370 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtssO70370 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CtssO70370 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CtssO70370 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtssO70370 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtssO70370 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CtssO70370 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtssO70370 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtssO70370 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtssO70370 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtssO70370 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtssO70370 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtssO70370 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtssO70370 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtssO70370 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtssO70370 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtssO70370 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtssO70370 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtssO70370 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtssO70370 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtssO70370 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtssO70370 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtssO70370 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtssO70370 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtssO70370 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtssO70370 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtssO70370 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtssO70370 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtssO70370 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtssO70370 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtssO70370 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtssO70370 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtssO70370 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtssO70370 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtssO70370 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtssO70370 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtssO70370 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtssO70370 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtssO70370 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtssO70370 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtssO70370 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtssO70370 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtssO70370 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtssO70370 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtssO70370 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtssO70370 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtssO70370 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtssO70370 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtssO70370 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtssO70370 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtssO70370 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtssO70370 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtssO70370 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtssO70370 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtssO70370 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtssO70370 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtssO70370 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtssO70370 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtssO70370 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtssO70370 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtssO70370 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtssO70370 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtssO70370 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtssO70370 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtssO70370 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtssO70370 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms