Protein–RNA interactions for Protein: O70343

Ppargc1a, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1aO70343 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1aO70343 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1aO70343 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ppargc1aO70343 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1aO70343 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1aO70343 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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