Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmx1O70218 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmx1O70218 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms