Protein–RNA interactions for Protein: O70169

Prss39, Inactive serine protease 39, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss39O70169 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prss39O70169 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prss39O70169 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prss39O70169 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prss39O70169 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prss39O70169 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prss39O70169 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prss39O70169 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prss39O70169 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prss39O70169 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prss39O70169 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prss39O70169 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prss39O70169 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prss39O70169 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss39O70169 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss39O70169 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss39O70169 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss39O70169 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prss39O70169 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms