Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl35aO55142 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms